Sự xuất hiện liên tục của các dạng sống khổng lồ không xác định được gọi là "Loài S-Class" đã trở nên phổ biến ở Nhật Bản. Vũ khí thông thường không ảnh hưởng đến chúng. Sau khi hết các lựa chọn khác, Chính phủ Nhật Bản đã ban hành Nghị định thư về đàn áp loài S-Class và thành lập một đơn vị thực thi, được gọi là SSSP. Các thành viên được chọn cho đơn vị là Lãnh đạo Kimio Tamura, Nhà chiến lược điều hành Shinji Kaminaga, Nhà vật lý không phân tử Taki Akihisa, và Nhà sinh vật học phổ quát Yume Funaberi. Khi mối đe dọa của các Loài S-Class trở nên tồi tệ hơn, một người khổng lồ màu bạc xuất hiện từ bên ngoài bầu khí quyển của Trái đất. Nhà phân tích Hiroko Asami mới được bổ nhiệm vào SSSP để đối phó với gã khổng lồ này và được hợp tác với Shinji Kaminaga. Trong báo cáo của Hiroko, cô ấy viết ... "Ultraman (tên dự kiến), chưa rõ danh tính".